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公司新闻

2020年整年度RNA甲基化文献汇总

发布时间:2021-01-13 16:53 |  点击次数:

今天为大家搜索和统计了刚刚过去的一年里发表的RNA甲基化文献。Pubmed上2020年发表的甲基化的文献共830篇,累计影响因子5440,平均影响因子6.55。其中10分以上的文献150篇,5-10分205篇。按甲基化修饰类型来看,m6A修饰文章数量占总体的83%, 累计影响因子占82%;m5C、m1A、m7G、2’-O-甲基化的文章数量占比8%、1%、3%、5%,影响因子占7%、1%、4%、6%。云序生物是国内RNA修饰测序的领跑者,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前,云序已累计支持客户发表29篇高水平文章,合计影响因子191.25分,是国内支持发文多、累计影响因子高的公司。下面小编为大家总结了2020年各种RNA修饰的高分文章情况,作为2021年的RNA修饰研究提供一些参考借鉴。

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m6A文献
经pubmed统计,2020年发表的m6A文章共692篇。其中10分以上文章共118篇,占m6A文章总数的17%, 其中在《Nature Genetics》、《Molecular Cell》、《Molecular Cancer》、《Nat Chem Biol》、《Nat Commun》、《Nucleic Acids Res》、《J Hematol Oncol》杂志上发表的文章较多。影响因子5-10分以的杂志中,发表m6A研究较多的杂志有《Cancer Res》、《PNAS》、《Mol Ther》、《Theranostics》、《Theranostics》、《Oncogene》、《EMBO Rep》、《J Exp Clin Cancer Res》、《Mol Ther Nucleic Acids》、《Plant Physiol》、《Cell Death Dis》、《J Cell Physiol》、《RNA Biol》、《Front Cell Dev Biol》、《Am J Cancer Res》,5分以下的杂志《Front Oncol》、《Aging (Albany NY)》、《Int J Mol Sci》、《J Cell Mol Med》、《Cancer Cell Int》、《Epigenomics》、《Front Genet》等均是发表m6A研究尤其多的杂志。

 

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m5C文献

去年m5C文章共68篇,高分杂志《Nat Commun》、《Nucleic Acids Res》,较低分杂志《Am J Transl Res》等发表的m5C文章较多。其中,研究最多的酶以NSUN2为首,并且除了mRNA以外,去年发表的m5C文章中有多篇将焦点转移到lncRNA和circRNA上。
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m1A文献
M1A的研究目前还比较少,2020年以m1A为研究重点的文章仅8篇,多是表达谱的文章及reader蛋白功能机制的探索。
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m7G文献
M7G的研究主比较多的集中在miRNA上,主要报道了这种修饰受METTL1甲基化酶的影响调控情况。另外很多涉及m7G的研究多是关注mRNA 5’端帽子结构中的m7G修饰,但是也开始有文章关注mRNA内部m7G修饰,并有一些方法学以及m7G预测相关的文章发表。下表从m7G作为关键词搜索到的文献中筛选出的部分文章。
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2’-O甲基化文献
2’-O甲基化相关文献去年发表了38篇,目前的研究多集中在病毒中,对象分子多为snRNA以及miRNA、tRNA、piRNA等小分子RNA.
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云序RNA修饰课题技术服务五大模块:
1 RNA修饰测序
MeRIP-seq
通过使用抗体富集高甲基化的RNA片段,然后结合高通量测序,在全转录组范围内研究发生甲基化的RNA区域
2 RNA修饰靶基因验证
 MeRIP-qPCR
云序提供的MeRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。
3 机制互作研究
RIP-seq/qPCR
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制。
RNA pull down -MS/WB
筛选或验证目标RNA互作基因或蛋白,研究相应的分子调控机制。
双荧光素酶实验
验证两基因互作,研究相应的分子调控机制。
4 RNA修饰上游酶的筛选
RNA修饰相关酶PCR芯片
寻找上游直接调控RNA修饰的相关酶。
5 检测整体RNA修饰水平
LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平
准确高效,可以实现一次检测,9类修饰水平检测,一步到位。
比色法检测整体m6A甲基化水平


云序生物客户RNA修饰测序文章列表
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点击下方链接获取RNA甲基化视频讲座内容

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