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何川教授最新Science揭秘m6A修饰新功能 -- 调控染色质状态和转录活性
发布时间:2020-01-20 17:34 | 点击次数:
文章导读
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。
2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济大学高亚威教授合作在顶级国际期刊Science上首次揭示了关于RNA的m6A甲基化修饰调控染色质状态和转录活性的重要机制,不仅刷新了我们对m6A功能的认识,而且为研究m6A作用方式提供了新的思路与研究视角,具有重要科研意义。
图注:m6A降低能增加新生转录本和染色质开放性
图注:carRNA的表达水平受m6A调控
图注:m6A修饰延长carRNA的半衰期
图注:m6A修饰的carRNAs影响基因的表达和转录率
(5)m6A修饰的carRNAs提高染色质开放性为了探究carRNA m6A甲基化程度改变能够影响染色质状态,作者利用ChIP-seq和m6A MeRIP-seq技术发现,在Mettl3 KO mESCs中,m6A-marked carRNA基因中H3K4me3和H3K27ac增加比non-m6A carRNA基因更多(A)。这说明carRNA m6A甲基化程度的降低可以增加活性组蛋白标记的深度。作者还推测carRNAs可以招募CBP/EP300和YY1等蛋白来促进开放染色质和激活转录,并利用ChIP-seq技术揭示Mettl3 KO mESCs中EP300和YY1的结合能力较WT组增强(B、C),且EP300和YY1的结合与附近carRNAs的m6A甲基化程度呈负相关(D、E)。这表明这些m6A调控的carRNAs可以通过激活相关蛋白稳定开放的染色质状态。
图注:m6A丰度的carRNAs提高染色质开放性
图注:m6A降低能提高染色质的开放性并激活转录
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