“表观转录组学”是通过转录后修饰影响RNA的结构和功能，是近几年来生物学科里最热门的研究领域之一，目前已知的RNA修饰类型超过150种，其中包括m6A、m5C、m1A、m7G、2’-氧-甲基化、ac4C RNA乙酰化等。近期小编发现在探究RNA修饰领域中，各位m6A研究领域的鼻祖们又有了新的动作。今年9月份，何川教授团队在Nature Methods发布了m1A甲基化修饰，中国科学院北京基因组研究所杨运桂及杨莹教授在Cell Research上发布了m7G甲基化修饰。继m6A成为明星之后，m5C、m1A、m7G、2’-氧-甲基化、ac4C RNA乙酰化这些明日之星也逐渐彰显潜力。
何川教授助力m1A甲基化修饰研究
2019年9月23日，美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果，该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台，可快速选择逆转录酶，使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点，并使其发生突变，从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测，在测序过程中产生突变标记，最终实现单碱基识别m1A，为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。

发表期刊：Nature Methods

影响因子：28.467

实验方法：m1A-seq

全文链接：https://sci-hub.se/10.1038/s41592-019-0550-4

研究内容

作者将筛选的HIV病毒逆转录酶应用于m1A-seq中，并分别在rRNA和tRNA中检测了m1A的突变特征。结果显示，在加入AlkB处理后，28 S rRNA 中m1A1322的突变率分别由78%和67%，下降到了21%和5%。作者观察了38个细胞质tRNA序列中m1A58的突变特征，发现AlkB处理后，也表现出了约86%突变率降低。同时，作者也检测了线粒体mRNA ND5 (chrM:13711)、PRUNE mRNA (chr1: 150980982)、lncRNA MALAT1 (chr11: 65273630)和28S rRNA中A1322位点的m1A突变率，这些结果都显示，加入AlkB处理后，高于50%的m1A突变率的下降。这说明，利用HIV病毒逆转录酶应用于二代测序能够量化和比较不同生物环境下各分子中的m1A修饰情况。

杨运桂/杨莹教授助力m7G表达谱研究

m7G是tRNA、rRNA和mRNA 5’帽子种最丰富的修饰之一，在调节RNA加工、代谢和功能方面具有重要作用。目前研究发现，m7G除了存在于mRNA的帽子区，还存在于mRNA内部区域。然而，其在转录组范围的分布和mRNA内部的调控仍然未知。

鉴于此，2019年9月13日，中国科学院北京基因组研究所杨运桂及杨莹教授在Cell Research上发表题目"Dynamic methylome of internal mRNA N7-methylguanosine and its regulatory role in translation" 的研究成果，该研究利用m7G-seq特异性检测mRNA内部m7G修饰。并且，揭示了m7G能够显著富集在mRNA 5’UTR区域和AG富集，在不同的人/小鼠细胞系及组织中具有良好的特征。值得注意的是，mRNA内部m7G修饰在H2O2和热休克处理下能够被动态调控，并且在CDS和3’UTR区域显著被富集，在促进mRNA翻译效率方面发挥作用。

该研究揭示了mRNA 内部m7G甲基化修饰的动态特征，并突出显示m7G可以考虑作为一种新的表观转录组标记。